Découverte, caractérisation et quantification de biomarqueurs

La technologie appropriée pour l’étude des biomarqueurs

La spectrométrie de masse (SM) est la technologie de choix pour le profilage protéomique à grande échelle et les études bioanalytiques quantitatives ciblées. Sensible, précise et exacte, elle est de plus en plus employée en clinique pour la découverte et la quantification de biomarqueurs dans le cadre du diagnostic et des interventions thérapeutiques.

Notre équipe de scientifiques cumule de nombreuses années d’expérience dans la mise au point et le perfectionnement des modes opératoires de la spectrométrie de masse pour la découverte, la caractérisation et la quantification de biomarqueurs à partir d’échantillons cliniques, tout en se conformant aux principes GCLP et à des programmes AQ/CQ rigoureux.

En savoir plus sur notre gamme complète de services de découverte et d’analyse de biomarqueurs qui vont bien au-delà de la spectrométrie de masse

Découverte de biomarqueurs par spectrométrie de masse

Caprion utilise la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem (CL-SM/SM) pour le profilage objectif d’un grand nombre de biomarqueurs. Réalisée sur des spectromètres de masse hybrides quadripôle/orbitrap à haute résolution et accompagnée d’une analyse statistique robuste, l’analyse objective par CL-SM/SM permet la détection et la quantification relative de milliers de protéines dans un seul échantillon sans avoir à marquer les protéines. La plateforme est compatible avec un large éventail de matrices biologiques, y compris le plasma, le sérum, le liquide céphalorachidien, les tissus, les cellules, etc.

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Grâce à la détection de réactions multiples (MRM), notre équipe scientifique peut mettre au point des panels personnalisés pour effectuer une quantification relative multiplexée et robuste d’un maximum de 350 protéines. Cette plateforme repose sur des spectromètres de masse quadripôle triples ou hybrides quadripôle triples/à piège à ions linéaire jumelés en amont à la chromatographie en phase liquide, ce qui se traduit par une sensibilité et une spécificité élevées. Souvent utilisée comme approche orthogonale à la suite d’expériences axées sur la découverte, cette plateforme est idéale pour évaluer rapidement un grand nombre de biomarqueurs candidats dans de multiples ensembles d’échantillons.

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Développement de biomarqueurs pour des applications cliniques

Tirant parti de la puissance de l’approche MRM, Caprion met au point et déploie également des analyses personnalisées permettant la quantification absolue de protéines pour des applications cliniques ou la soumission aux autorités règlementaires. Les panels peuvent être configurés pour mesurer des biomarqueurs pertinents sur le plan clinique à partir de divers types d’échantillons, y compris des échantillons fixés au formol et inclus dans la paraffine (FFIP), qui sont stables et facilement disponibles.

Selon vos besoins, la quantification des biomarqueurs dans les échantillons cliniques peut être effectuée à différents degrés de validation, dans un environnement GCLP, agréé par le CAP et certifié CLIA.

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Découvrez comment nous quantifions les biomarqueurs importants sur le plan clinique dans les tissus fixés

Panels prêts à l’emploi et analyses offertes

Des panels prêts à l’emploi sont disponibles pour faciliter le criblage rapide et la vérification d’un grand nombre de biomarqueurs protéiques candidats. Ainsi, notre panel conçu pour les maladies du système nerveux central permet de mesurer 142 protéines liées à la maladie de Parkinson et à d’autres atteintes neurologiques. Mis au point spécialement pour l’analyse du liquide céphalorachidien, il ne requiert que 75 μl d’échantillon et l’on peut facilement lui ajouter d’autres cibles. Des panels spécifiques à d’autres maladies, telles que les maladies cardiovasculaires, sont également disponibles.

Découvrez notre panel conçu pour les maladies du système nerveux central dans la publication suivante

Des tests validés hautement quantitatifs sont également offerts pour mesurer l’expression de cibles validées dans des échantillons cliniques. Le test ciblant l’antigène de maturation des lymphocytes B (BCMA) soluble, qui est utilisé pour quantifier l’expression de ce biomarqueur dans des échantillons de plasma, est immédiatement disponible.

En savoir plus sur notre dosage du BCMA

Caprion offre également un test multiplex pour quantifier dans des échantillons FFIP la protéine HER2, ainsi que 11 autres protéines liées à diverses tumeurs solides. Douze protéines, dont la détection dans des échantillons de tissu FFIP de patients atteints d’un cancer colorectal est validée, peuvent être mesurées en un seul dosage; ces protéines sont HER2, Ezrin, EGFR, AKT1, CEACAM5 (carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5), GRB2 (growth factor receptor-bound protein 2), IL18, CDK1, la protéine tyrosine kinase SYK, RIPK1 (receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1), l’homologue de Pescadillo et le proto-oncogène vav. Le dosage peut être rapidement personnalisé par l’ajout d’autres protéines d’intérêt.

Découvrez comment nous quantifions les biomarqueurs importants sur le plan clinique dans les tissus fixés

Ces tests de MRM quantitatifs sont mis au point par une approche adaptée à vos besoins et il est facile de les personnaliser par l’ajout d’autres protéines de votre choix.